難病の治療法発見の望みを未来に託し、人工睡眠していた21世紀の高校生・獅馬渡（しじまわたる）。しかし、目覚めた彼を待っていたのは、温暖化の影響で大陸の大部分が水没し、常夏の惑星と化した300年後の世界だった！　渡は、彼を目覚めさせた女の子だけの海賊団“血染めの人魚団”（ブラッディマーメイド）とともに、世界を滅ぼすといわれる前文明の遺産“水宝珠”（アクアオーヴ）を探しに出航する!!